
تعداد نشریات | 13 |
تعداد شمارهها | 623 |
تعداد مقالات | 6,502 |
تعداد مشاهده مقاله | 8,636,774 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 8,230,190 |
مطالعه تنوع کلروپلاستی برخی ژنوتیپهای سیب شمال غرب ایران در مقایسه با برخی ژنوتیپهای البرز مرکزی، ارقام و پایههای تجاری | ||
پژوهشهای تولید گیاهی | ||
مقاله 1، دوره 25، شماره 2، شهریور 1397، صفحه 1-15 اصل مقاله (567.83 K) | ||
نوع مقاله: پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22069/jopp.2018.9335.2202 | ||
نویسندگان | ||
شاهین جهانگیرزاده خیاوی* 1؛ معصومه عاشورپور2؛ شب ناز کشاورزی3 | ||
1پژوهشکده چای، مؤسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، لاهیجان، ایران | ||
2جهاد کشاورزی شهرستان رشت | ||
3گروه شیمی آلی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران ایران | ||
چکیده | ||
سابقه و هدف: سیب یکی از مهمترین محصولات میوهای مناطق معتدله میباشد. کشت و کار این محصول از زمانهای بسیار دور در ایران انجام میشد و حتی برخی منابع، ایران را یکی از زادگاههای این گیاه نامیدهاند. جمعآوری و ارزیابی ذخایر ژرم پلاسم داخلی و خارجی، اساسیترین مرحله در برنامههای بهنژادی درختان میوه میباشد. اصلاح درختان سیب، امروزه با توجه به اهمیت تغذیه سالم و تولید پایدار میوه با کیفیت بیشتر سیب، بر پایه ژنهای مقاومت میباشد. با توجه به اینکه اکثر واریتههای سیب به صورت رویشی تکثیر میگردند، تنوع ژنتیکی کمی مورد انتظار میباشد؛ اما در مورد ژنوتیپهای بومی که حاصل انتخاب ویژگیهای برتر میباشند، این تنوع مورد انتظار افزایش مییابد زیرا این ژنوتیپها اکثراً نتاج بذری میباشند. در این تحقیق سعی شده است نسبت به بررسی تنوع ژنتیکی اندامکی برخی ژنوتیپهای بومی سیب مربوط به مناطق کاشت عمده این محصول در شمال غرب ایران و البرز مرکزی و مقایسه آنها با دو رقم تجاری رد دلیشز و فوجی و دو پایه M4 و M9، اقدام گردد. مواد و روشها: بهمنظور انجام این تحقیق، نمونهبرداری از برگهای جوان و کاملاً توسعه یافته صورت گرفت و DNA ژنومی آنها استخراج شد. برای بررسی تنوع اندامکی، 30 نمونه سیب، چهار جفت آغازگر اختصاصی برای ژنوم کلروپلاست (K1K2، CS، HK و TF) و دو آنزیم برشی (EcoRI و MseI) در روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده (CAP) بکار برده شد. برنامههای NTSYS و POPGENE برای آنالیز دادهها، مورد استفاده قرار گرفتند. یافتهها: از بین این چهار نشانگر بکار برده شده، سه نشانگر دارای قدرت تکثیر مناسب بودند که در کل، 13/4 درصد کل ژنوم کلروپلاست سیب را تکثیر نمودند. با بررسی هاپلوتایپی نمونهها، در مجموع هشت هاپلوتایپ شناسایی شد که هاپلوتایپ H4 با پوشش 66/26 درصد از کل نمونهها، بزرگترین گروه بود. تمام این گروهبندیها به دلیل رخ دادن جهشهای حذف و اضافه ایجاد شده بود. حداکثر تنوع ژنتیکی (Ht)، میانگین تنوع بین جمعیتی (Hs) و تفاوت ژنتیکی بین جمعیتها (Gstc) به ترتیب 467/0، 4451/0 و 0481/0 بدست آمد. نتیجهگیری: نتایج این بررسی نشان داد که هیچگونه ساختار ژنتیکی مدونی مابین نمونههای مناطق مورد بررسی وجود ندارد؛ همچنین این نتایج تأیید نمودند که امکان کاربرد روش چندشکلی شکافتن قطعات تکثیر شده برای شناسایی ژنوتیپهای سیب و ارقام آن وجود دارد. با استفاده از این نشانگرها، تنوع ژنتیکی در DNA اندامکی بین ژنوتیپهای سیب مشاهده شد اما این تنوع بهگونهای نبود که قادر باشد ژنوتیپهای مناطق مختلف را از هم منفک نماید. به نظر میرسد شاید با افزایش تعداد آغازگرها و آنزیمهای برشی، بتوان به این تفکیک دستیافت. همچنین نتایج این بررسی نشان داد که ژنوتیپهای سیب بومی ایران به دلیل آنکه اکثراً درگذشته بهصورت جنسی تکثیر شدهاند، دارای تنوع ژنتیکی بالایی میباشند. | ||
کلیدواژهها | ||
Malus؛ هاپلوتایپ؛ چندشکلی شکافتن قطعات تکثیرشده (CAP)؛ پرایمر عمومی کلروپلاست؛ آنزیم برشی | ||
مراجع | ||
1.Arnold, M.L., Buckner, C.M. and Robinson, J.J. 1991. Pollen-mediated introgression and hybrid speciation in Louisiana irises. Proc. Nat. Acad Sci. USA. 88: 1398-1402. 2.Bouhadida, M., Martín, J.P., Eremin, G., Pinochet, J., Moreno, M.Á. and Gogorcena, Y. 2007. Chloroplast DNA diversity in Prunus and its implication on genetic relationships. J. Am. Soc. Hort. Sci. 132 :5. 670-679. 3.Coart, E., Van Glabeke, S., De Loose, M., Larsen, A.S. and Roldan-Ruiz, I. 2006. Chloroplast diversity in the genus Malus: New insights into the relationship between the European wild apple (Malus sylvestris (L.) Mill.) and the domesticated apple (Malus domestica Borkh.). Mol Ecol. 15: 2171-2182. 4.Demesure, B., Comps, B. and Petit, R.J. 1996. Chloroplast DNA phylogeography of the common beech (Fagus sylvatica L.) in Europe. Evolution. 50: 2515-2520. 5.Demesure, B., Sodzi, N. and Petit, R.J. 1995. A set of universal primers for amplification of polymorphic non-coding regions of mitochondrial and chloroplast DNA in plants. Mol Ecol. 4: 129-131. 6.Dumolin-Lapegue, S., Pemonge, M.. and Petit, R.J. 1997. An enlarged set of consensus primers for the study of organelle DNA in plants. Mol. Ecol. 6: 393-397. 7.El-Mousadik, A. and Petit, R.J. 1996. Chloroplast DNA phylogeography of the argan tree of Morocco. Mol. Eco. 5: 547-555. 8.Fofona, B., Harvengt, L., Baudoin, J.P. and Du Jardin, P. 1997. New primers for the polymerase chain reaction of cpDNA intergenic spacers in Phaseolus phylogeny. Belg. J. Bot. 129: 118-122. 9.Golein, B., Bigonah, M., Azadvar, M. and Golmohammadi, M. 2012. Analysis of genetic relationship between ‘Bakraee’ (Citrus sp.) and some known Citrus genotypes through SSR and PCR-RFLP markers. Sci. Hort. 148: 147-153. 10.Grivet, D., Heinze, B., Vendraminà, G.G. and Petit, R.J. 2001. Genome walking with consensus primers: Application to the large single copy region of chloroplast DNA. Mol. Ecol. Not. 1: 345-349. 11.Heinze, B. 1998. PCR based chloroplast DNA assay for the identification of native Populus nigra and introduced poplar hybrids in Europe. Forest Genet. 5: 33-40. 12.http://www.diversityarrays.com/sites/default/files/pub/DArT_DNA_isolation.pdf. 13.Ishikawa, S., Kato, S., Imakawa, S., Mikami, T. and Shimamoto, Y. 1992. Organel DNA polymorphism in apple cultivars and rootstocks. Theor. Appl. Genet. 83: 963-967. 14.Jahangirzadeh Khiavi, Sh., Zamani, Z., Mardi, M. and Fatahi Moghdam, M. 2013. Evaluation of chloroplast relationship between some apple genotype from Azerbaijan of Iran and their comparison with other local genotypes, cultivars and rootstocks. Afri. J. Agri. Res. 8: 1. 106-112. 15.Jahangirzadeh Khiavi, Sh. and Keshavarzi, Sh. 2016. Study of chloroplast haplotypes distribution in some apple genotypes from central Alborz region by using PBR method. Third international and sixth confrence of medical herbs and stable agricalture. December 11. Iran. Hamedan. (In Persian) 16.Jahangirzadeh Khiavi, Sh., Hamidoghli, Y., Golein, B. and Sabouri, A. 2017. Haplotype Identification of Some Lime Genotypes from Minab Region by Usage of Chloroplast Genome. First International Conference & 10th National Horticultural Science Congress of Iran (IrHC2017). September 4-7. Iran. Tehran. (In Persian) 17.Mabberley, D.J., Jarvis, C.E. and Juniper, B.E. 2001. The name of the apple. Telopea J. 9: 421-430. 18.Mariac, C., Trouslot, P., Poteaux, C., Bezancon, G. and Renno, J.F. 2000. Chloroplast DNA extraction from herbaceous and woody plants for direct restriction fragment length polymorphism analysis. Biotechniques. 28: 110-113. 19.Mohanty, A., Martín, J.P. and Aguinagalde, I. 2001. Chloroplast DNA study in wild populations and some cultivars of Prunus avium L. . Theor. Appl. Genet. 103: 112-117. 20.Mohanty, A., Martin, J.P., Gonzalez, L.M. and Aguinagalde, I. 2003. Association between chloroplast DNA and mitochondrial DNA haplotypes in Prunus spinosa L. (Rosaceae) populations across Europe. Ann. Botany. 92: 749-755. 21.Mohanty, A., M., J.P. and Aguinagalde, I. 2000. Chloroplast DNA diversity within and among populations of the allotetraploid Prunus spinosa L. Theor. Appl. Genet. 100: 1304-1310. 22.Palmer, J.D. and Stein, D.B. 1986. Conservation of chloroplast genome structure among vascular plant. Curr. Genet. 10: 823-833. 23.Panda, S., Pedro Martin, J. and Aguinaglde, I. 2003. Chloroplast DNA study in sweet cherry cultivars (Prunus avium L.) using PCR-RFLP method. Genet. Resour. Crop Evol. 50: 489-495. 24.Petit, R.J., Kremer, A. and Wagner, D.B. 1993a. Geographic structure of chloroplast DNA polymorphisms in European oaks. Theor. Appl. Genet. 87: 122-128. 25.Phipps, J.B., Robertson, K.R., Smith, P.G. and Rohrer, J.R. 1990. A checklist of the subfamily Maloideae (Rosaceae). Can J. Bot. 68: 10. 2209-2269. 26.Sears, B.B. 1980. Elimination of plastids during spermatogenesis and fertilization in the plant kingdom. Plasmid. 4: 233-255. 27.Sugiura, M. 2003. History of chloroplast genomics. Photosyn Res. 76: 371-377. 28.Taberlet, P., Gielly, L., Pautou, G. and Bouvet, J. 1991. Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Mol. Biol. 17: 1105-1109. 29.Turkec, A., Sayar, M. and Heinze, B. 2006. Identification of sweet cherry cultivars (Prunus avium L.) and analysis of their genetic relationships by chloroplast sequence-characterised amplified regions (cpSCAR). Genet. Resour. Crop Evol. 53: 1635-1641. 30.Weising, K. and Gardner, R.C. 1999. A set of conserved PCR primers for the analysis of simple sequence repeat polymorphisms in chloroplast genomes of dicotyledonous angiosperms. Genome. 42: 9-19. 31.Whatley, J.M. 1982. Ultrastructure of plastid inheritance: Green algae to angiosperms. Biol. Rev. 57: 527-569. 32.Zeinalabedini, M., Mahjourhat, K., Khayam-Nekoui, M., Grigorian, V., Toorchi, M., Dicenta, F. and Martinez-Gomez, P. 2007. Molecular characterization of almond cultivars and related wild species using nuclear and chloroplast DNA markers. J. Food. Agri. Envir. 5: 3&4. 242-247. 33.Zohary, D. and Hopf, M. 2001. Domestication of Plants in the Old World: The Origin and Spread of Cultivated Plants in West Asia, Europe, and the Nile Valley. Oxford University Press. 328p. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 532 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 563 |